R1a1 (L120/M516/PF6236, L122/M448/PF6237, M459/PF6235, Page65.2/PF6234/SRY1532.2/SRY10831.2)
R1a1a (L168, L449/PF6223, M17, M198/PF6238, M512/PF6239, M514/PF6240, M515) — у брахманов из Западной Бенгалии достигает 72 %, у пуштунов Афганистана до 51 %, у манипури Индии — 50 %. В польских, российских и украинских регионах колеблется в районе 50-65 %.
R1a1a1 (M417, Page7)
R1a1a1a (CTS7083/L664/S298) — встречается в Восточной Европе.
R1a1a1b (S224/Z645, S441/Z647)
R1a1a1b1 (PF6217/S339/Z283) — ветвь, преобладающая в Центральной и Восточной Европе.
R1a1a1b1a (S198/Z282)
R1a1a1b1a1 (M458/PF6241) — преимущественно балто-славянская ветвь, с максимальной частотой фиксируемая в Польше, Литве, Чехии и Словакии, но также совершенно обычная в Северо-западной России и на Юго-востоке Украины.
R1a1a1b1a1a (L260/S222) — чётко соотносится с западными славянами, пик её частоты приходится на Польшу, Чехию и Словакию, также зона распространения затрагивает Восточную Германию, Восточную Австрию, Словению и Венгрию.
R1a1a1b1a1b (CTS11962)
R1a1a1b1a1b1 (L1029/S4554)
R1a1a1b1a2 (S204/Z91, S466/Z280) — является восточноевропейской меткой (возможно, балто-славянской), встречается по всей Центральной и Восточной Европе, западная граница распространения протягивается от Восточной к Юго-западной Германии и далее к Северо-восточной Италии. Внутри ветви выделяется несколько кластеров, изученных пока лишь в общих чертах: восточно-славянский, балтский, померанский, польский, карпатский, восточно-альпийский, чехословацкий и другие.
R1a1a1b1a2a (S205/Z92, S344/Z660, S446/Z661) — восточнославянский кластер, возможно, имеет балтское (восточнобалтское) происхождение. Большая часть носителей проживает в России и Белоруссии. Встречается в Польше, Литве, Финляндии и Украине.
R1a1a1b1a2b (CTS1211)
R1a1a1b1a2b1 (P278.2)
R1a1a1b1a2b2 (L784)
R1a1a1b1a2b3 (CTS3402/S3361)
R1a1a1b1a2b3a (L365/S468) — померанский кластер, больше всего носителей проживает в Польше и Германии (зачастую носят фамилии славянского происхождения).
R1a1a1b1a2b3a1 (F2686)
R1a1a1b1a2b3b (L366)
R1a1a1b1a2b3c (L1280)
R1a1a1b1a3 (S221/Z284, S443/Z289) — скандинавская ветвь, наибольшая концентрация в Норвегии. Также встречается в землях, где норвежские викинги устраивали свои колонии, например, в некоторых областях Шотландии, Англии и Ирландии.
R1a1a1b1a3a (L448/S200)
R1a1a1b1a3a1 (CTS4179)
R1a1a1b1a3a1a (L176.1/S179.1)
R1a1a1b1a3b (S223/Z287, S345/Z288)
R1a1a1b1a3b1 (CTS8401)
R1a1a1b1a3b1a (S201/Z87, S342/Z88)
R1a1a1b1a3b2 (CTS8277)
R1a1a1b1a3c (CTS4027)
R1a1a1b2 (F992/S202/Z93) — основная азиатская ветвь R1a. Найдена в Центральной, Южной и Юго-западной Азии (в том числе у евреев-ашкеназов). Z93 является меткой многих народов, таких как индо-иранцы (арии), персы, мидийцы, митаннцы, башкиры, а также входит в генофонд арабов и евреев.
R1a1a1b2a (L342.2/S278.2, F3105, S340/Z94)
R1a1a1b2a1 (L657/S347) — встречается в Центральной и Южной Азии
R1a1a1b2a1a (Y7)
R1a1a1b2a2 (Z2124)
R1a1a1b2a2a (Z2123)
R1a1a1b2a2b (S4576/Z2122)
R1a1a1b2a2b1 (F1345)
R1a1a1b2a2b1a (CTS6/S3403)
R1a1a1b2a2b1b (F2935)
R1a1a1b2a2b2 (Y57)